RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 Q6ZUG5 572 aa29.81■■■□□ 2.36
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF558Q96NG5 402 aa29.81■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 PRRX2Q99811 253 aa29.81■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.81■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 NRBP2Q9NSY0 501 aa29.81■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 RNF19AQ9NV58 838 aa29.81■■■□□ 2.36
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PBRM1-218ENST00000458294 KRT17Q04695 432 aa29.8■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.8■■■□□ 2.36
PBRM1-218ENST00000458294 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.8■■■□□ 2.36
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PBRM1-218ENST00000458294 PRSS33Q8NF86 280 aa29.77■■■□□ 2.36
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PBRM1-218ENST00000458294 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
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PBRM1-218ENST00000458294 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PBRM1-218ENST00000458294 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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