RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	SRL	Q86TD4	932 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	METTL13	Q8N6R0	699 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ARL8A	Q96BM9	186 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RUFY1	Q96T51	708 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GML	Q99445	158 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GPR88	Q9GZN0	384 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CEP104	O60308	925 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RIT2	Q99578	217 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LXN	Q9BS40	222 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	NCAN	O14594	1321 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LMNB1	P20700	586 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CYP2J2	P51589	502 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GALC	P54803	685 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PEX26	Q7Z412	305 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DAW1	Q8N136	415 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	NEK9	Q8TD19	979 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54	1e-7	■□□□□ 10
TOM1-210	ENST00000449058	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FEM1B	Q9UK73	627 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D12	O60347	775 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	IRAK1	P51617	712 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	HSD17B4	P51659	736 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TRADD	Q15628	312 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CD302	Q8IX05	232 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ISCU	Q9H1K1	167 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	HIP1R	O75146	1068 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CFAP58	Q5T655	872 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	BANK1	Q8NDB2	785 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	HES6	Q96HZ4	224 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM253	P0C7T8	217 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM49	P0CI25	452 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM49C	P0CI26	452 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	BCR	P11274	1271 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ERVK-9	P63128	1117 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SKOR1	P84550	965 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RPTOR	Q8N122	1335 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF233	A6NK53	670 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC188	H7C350	402 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	MYO1C	O00159	1063 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	C21orf2	O43822	256 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ITGB5	P18084	799 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GUCY2F	P51841	1108 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	MYL7	Q01449	175 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	BFSP1	Q12934	665 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DAAM2	Q86T65	1068 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ECHS1	P30084	290 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CAP2	P40123	477 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PTGER2	P43116	358 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CUL1	Q13616	776 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PTPRO	Q16827	1216 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LMO3	Q8TAP4	145 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RFFL	Q8WZ73	363 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	GRIN2D	O15399	1336 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54

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