RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EML5Q05BV3 1969 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1B0GTL3 188 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFBP00751 764 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITPKBP27987 946 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2G6O60733 806 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ICAM1P05362 532 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS52Q8N1B4 723 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MKL1Q969V6 931 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PADI3Q9ULW8 664 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INPPL1O15357 1258 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPH3Q86UC2 560 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMX1Q9H3N1 280 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZAP70P43403 619 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM193AP78312 1265 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4F3Q08477 520 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA3BQ13214 749 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LY6DQ14210 128 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLK5Q496M5 336 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNB1P11230 501 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CR2P20023 1033 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL12RB1P42701 662 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNAP25P60880 206 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS6P62753 249 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP4P98171 946 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CREB5Q02930 508 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDXDC1Q6P996 788 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC43Q8N309 656 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF12Q96QT6 1004 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APAF1O14727 1248 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC192P0DO97 292 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA3FQ13275 785 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C12orf60Q5U649 245 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLFN13Q68D06 897 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNASE1L2Q92874 299 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHKBQ93100 1093 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL4A2P08572 1712 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGFR1P11362 822 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLRC2P26717 231 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAK2Q13177 524 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTGDRQ13258 359 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM169Q96HH4 297 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA33Q96N06 139 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASD1Q96PB1 797 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF20Q9BVI0 1012 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDH7Q9ULB5 785 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNA1DQ01668 2161 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NF1P21359 2839 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9IYK1 514 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LGALS2P05162 132 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms