RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 FSD2A1L4K1 749 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 MBTPS2O43462 519 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 STBD1O95210 358 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SCRN1Q12765 414 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CWH43Q9H720 699 aa23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01565O15544 149 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 EYA4O95677 639 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NEFLP07196 543 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 FGFR1P11362 822 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ALADP13716 330 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LAG3P18627 525 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC15P60006 121 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 IGFLR1Q9H665 355 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CD207Q9UJ71 328 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LZTS1Q9Y250 596 aa23.61■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PFKFB2O60825 505 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 FGF18O76093 207 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 XBP1P17861 261 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFV1P49821 464 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 INF2Q27J81 1249 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TLR9Q9NR96 1032 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 RNF19AQ9NV58 838 aa23.6■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SLC37A4O43826 429 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CSPG5O95196 566 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PLCB3Q01970 1234 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 COASYQ13057 564 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R5CQ13362 524 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC43Q8N309 656 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP7Q8WX94 980 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 FAM20AQ96MK3 541 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CASD1Q96PB1 797 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DACT1Q9NYF0 836 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.59■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0U1RQF3 1178 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 EOMESO95936 686 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NRIP1P48552 1158 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DNM2P50570 870 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC5P62195 406 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DRP2Q13474 957 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD1Q15327 319 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LETM2Q2VYF4 491 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 MTERF2Q49AM1 385 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NEK8Q86SG6 692 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SCLT1Q96NL6 688 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CHST12Q9NRB3 414 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC1BQ9P126 229 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 HCSTQ9UBK5 93 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 VAV3Q9UKW4 847 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.58■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PRR33A8MZF0 331 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 FSCN2O14926 492 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 TBX3O15119 743 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.362e-13■■■■■ 60.1
LIMS1-208ENST00000428064 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 GLP2RO95838 553 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CLUL1Q15846 466 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF410Q86VK4 478 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ABI1Q8IZP0 508 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PPME1Q9Y570 386 aa23.57■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 DCXO43602 365 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1AP35813 382 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G5P39877 138 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ANO5Q75V66 913 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 TLE6Q9H808 572 aa23.56■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM150BA6NC51 233 aa23.55■■□□□ 1.36
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