RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF139Q8WU17 664 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SAAL1Q96ER3 474 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KLC2Q9H0B6 622 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CLRN2A0PK11 232 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP10DQ9P241 1426 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LGALS16A8MUM7 142 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF18P17022 549 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX5P35711 763 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 OSTNP61366 133 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SLAIN2Q9P270 581 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT2P52630 851 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FSCBQ5H9T9 825 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC13Q8NBP0 860 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF217Q8TC41 542 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB18Q99592 522 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5C2P49902 561 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGDIAP52565 204 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 OCA2Q04671 838 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKHQ86XP1 1220 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ING2Q9H160 280 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 E2F6O75461 281 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PALMO75781 387 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNA8P32881 189 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP14P54578 494 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FAF2Q96CS3 445 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TAC1P20366 129 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMA2P25787 234 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MORF4L2Q15014 288 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC13DQ70J99 1090 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DONSONQ9NYP3 566 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 F8W8V4 182 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GDF11O95390 407 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 Q3C1V9 767 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM15Q9C019 465 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS5O94927 633 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L8P0C7I0 530 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CDO1Q16878 200 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF19Q2TAC6 998 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC4Q7Z404 712 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB33Q86T24 672 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GMNCA6NCL1 334 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 BBOX1O75936 387 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 BRAFP15056 766 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NPR1P16066 1061 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2SQ16763 222 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZWILCHQ9H900 591 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms