RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT74Q96LB3 600 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB118Q96PH6 123 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETD4Q9NVD3 440 aa18.73■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 KBTBD13C9JR72 458 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNM1LO00429 736 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMOD1P28289 359 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXC8P31273 242 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL2P36404 184 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMTNP53814 917 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP2R5AQ15172 486 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SESTD1Q86VW0 696 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM143Q96AN5 459 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLD4Q9HCU8 107 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDAQ9Y2T3 454 aa18.72■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0YCG3 227 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCD1P33897 745 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAM17P78536 824 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALCAMQ13740 583 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADSSL1Q8N142 457 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL13Q8N6R0 699 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPS3Q969F9 1004 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF24Q9UPV7 400 aa18.71■□□□□ 0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASAP2O43150 1006 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN2P17655 700 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRCPP42785 496 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPTX2P47972 431 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF165P49910 485 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEX3P56589 373 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX10P56693 466 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 FIZ1Q96SL8 496 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.7■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMA7O14818 248 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJB1P08034 283 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAMPTP43490 491 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCKAP1LP55160 1127 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42EP1Q00587 391 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP7D2Q96T17 732 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQY0 241 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC169A6NNP5 214 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ENM7 598 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCNT3O95395 438 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGPL1O95470 568 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLRA2P23416 452 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLCN3P51790 818 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFDP1Q14186 410 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 BSNDQ8WZ55 320 aa18.68■□□□□ 0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNN1Q92952 543 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms