RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415017.1

CNN3-203, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-203ENST00000415017 GNAT1P11488 350 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 PSMD2Q13200 908 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 DRP2Q13474 957 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 SERINC5Q86VE9 423 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 SMARCE1Q969G3 411 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 DRC1Q96MC2 740 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 PANK4Q9NVE7 773 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ALPK3Q96L96 1907 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 TREHO43280 583 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 PLS3P13797 630 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 GLRA2P23416 452 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 NCKAP1LP55160 1127 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 SOX10P56693 466 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ASIC1P78348 528 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 RBL2Q08999 1139 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 COASYQ13057 564 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 RETREG2Q8NC44 543 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 TCP11Q8WWU5 503 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 BSNDQ8WZ55 320 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 PARVGQ9HBI0 331 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 RMND1Q9NWS8 449 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-203ENST00000415017 ASAP2O43150 1006 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 CD4P01730 458 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ZNF445P59923 1031 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 STK4Q13043 487 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 NME8Q8N427 588 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TMEM143Q96AN5 459 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 POLD4Q9HCU8 107 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 SFI1A8K8P3 1242 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 SCP2P22307 547 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 NAMPTP43490 491 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 NPTX2P47972 431 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 IGBP1P78318 339 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 CDC42EP1Q00587 391 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 PTK7Q13308 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 CAPSQ13938 189 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 SFR1Q86XK3 245 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 WNT8BQ93098 351 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TOX2Q96NM4 488 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 GPR32O75388 356 aa14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 FAM13AO94988 1023 aa14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 CYP2C9P11712 490 aa14.68□□□□□ -0.06
CNN3-203ENST00000415017 IDEP14735 1019 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms