RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZBP1Q9H171 429 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TDGQ13569 410 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CLCN3P51790 818 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 SIX5Q8N196 739 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM169Q96HH4 297 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ANO3Q9BYT9 981 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC69A6NI79 296 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 PRC1O43663 620 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 GPR149Q86SP6 731 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 KCNK12Q9HB15 430 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF292O60281 2723 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0U1RQF3 1178 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CTSAP10619 480 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 FGFR4P22455 802 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CASC1Q6TDU7 716 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CABP7Q86V35 215 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 AKT3Q9Y243 479 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 IRAK3Q9Y616 596 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 R4GN57 208 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF76P36508 570 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CALM1P0DP23 149 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CALM2P0DP24 149 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CALM3P0DP25 149 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CHMLP26374 656 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 SREBF1P36956 1147 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 NAPAP54920 295 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 TMTC2Q8N394 836 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MTA3Q9BTC8 594 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 KRBA1A5PL33 1030 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 FAM86B1E9PN63 330 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 STK25O00506 426 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 CFHP08603 1231 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 GIT2Q14161 759 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 FANCBQ8NB91 859 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MAP4K1Q92918 833 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 IGSF21Q96ID5 467 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEB2O15479 319 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 GPC3P51654 580 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM87BQ96K49 555 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 MAP7D2Q96T17 732 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms