RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RASGRF2	O14827	1237 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TDP2	O95551	362 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	COPS2	P61201	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PPAT	Q06203	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PLS1	Q14651	629 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NFIL3	Q16649	462 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CYP11B2	P19099	503 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLC9A1	P19634	815 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SOX5	P35711	763 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GALC	P54803	685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NCALD	P61601	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	BNIP1	Q12981	228 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CNGA2	Q16280	664 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SERPINB12	Q96P63	405 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	BACH1	O14867	736 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GJB6	O95452	261 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RARA	P10276	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	GCK	P35557	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TNNI2	P48788	182 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PLTP	P55058	493 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	AGAP11	Q8TF27	550 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	STK33	Q9BYT3	514 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	COL4A1	P02462	1669 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RIPK2	O43353	540 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	UBOX5	O94941	541 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SHBG	P04278	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ACTN1	P12814	892 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	CDK8	P49336	464 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ITPK1	Q13572	414 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	SLC29A2	Q14542	456 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PPARG-208	ENST00000397023	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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