RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 IKBKBO14920 756 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 GCNT3O95395 438 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 KIFAP3Q92845 792 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 FANCLQ9NW38 375 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 MYH11P35749 1972 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 PSMA7O14818 248 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 AP5Z1O43299 807 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 STIM1Q13586 685 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.71■■□□□ 1.71
CNN3-202ENST00000394202 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ARL2P36404 184 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 NPTX2P47972 431 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 NKX3-2P78367 333 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SETD4Q9NVD3 440 aa25.7■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 HAS3O00219 553 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 C22orf31O95567 290 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 HIC1Q14526 733 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 MFSD10Q14728 455 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CENPPQ6IPU0 288 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 TTI2Q6NXR4 508 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 P2RX5Q93086 422 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 STRA6Q9BX79 667 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SLC16A4O15374 487 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CCNE1P24864 410 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KLRC1P26715 233 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PSEN2P49810 448 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PPFIA1Q13136 1202 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 GRIK4Q16099 956 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SPC25Q9HBM1 224 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PPME1Q9Y570 386 aa25.69■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SMTNL1A8MU46 457 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 GJB1P08034 283 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 GLRA2P23416 452 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 LHX8Q68G74 356 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.68■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CCDC169A6NNP5 214 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R37O75864 691 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CLCN3P51790 818 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 UVSSAQ2YD98 709 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SPATA1Q5VX52 437 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 METTL13Q8N6R0 699 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 K7ENM7 598 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ATP1A3P13637 1013 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 RTP1P59025 263 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KCNA10Q16322 511 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 NCKAP1LP55160 1127 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.66■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R2P41236 205 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 COL1A2P08123 1366 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ASGR1P07306 291 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 PLCB2Q00722 1185 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.65■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.64■■□□□ 1.7
CNN3-202ENST00000394202 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms