RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 EYSQ5T1H1 3165 aa22.64■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DSC3Q14574 896 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF174Q15697 407 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 THEGQ9P2T0 379 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 C9IYK1 514 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 DLL1O00548 723 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB39O15060 712 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 SLITRK3O94933 977 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00271P0C7V0 271 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNNB1P35222 781 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 GATMP50440 423 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC42EP1Q00587 391 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 GPM6BQ13491 265 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 XKR9Q5GH70 373 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC38Q5R3I4 469 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PPME1Q9Y570 386 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087WZ62 844 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEMA6NI47 508 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BNC9 293 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 FGFR4P22455 802 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 RFC5P40937 340 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 MCM2P49736 904 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK9Q8TD19 979 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF3AQ9Y496 699 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TRANK1O15050 2925 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 OR52Z1P0C646 297 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 BMPR1AP36894 532 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF410Q86VK4 478 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 KSR1Q8IVT5 923 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM143Q96AN5 459 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP4Q96MN2 994 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 LYPLA2O95372 231 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 RB1P06400 928 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAPPC10P48553 1259 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM189BP81408 668 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 EMC2Q15006 297 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TECP42680 631 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 NBR1Q14596 966 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPROQ16827 1216 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 GJB2P29033 226 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087WWV3 80 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 FGFR1P11362 822 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MCTP1Q6DN14 999 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TCP11Q8WWU5 503 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MTRQ99707 1265 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 BACH2Q9BYV9 841 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TFF2Q03403 129 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms