RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 CEP89Q96ST8 783 aa16.6■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.6■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 NBNO60934 754 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 MED24O75448 989 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 PFKMP08237 780 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 RPA1P27694 616 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 SYKP43405 635 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 TPM4P67936 248 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 MBTPS1Q14703 1052 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 TDHQ8IZJ6 230 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 METTL13Q8N6R0 699 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.59■□□□□ 0.25
PXDC1-201ENST00000380277 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 A0A1W2PPC1 479 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SMTNL1A8MU46 457 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 ZBTB39O15060 712 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CHRNA1P02708 482 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 NPEPPSP55786 919 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MGAT3Q09327 533 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 FAM26DQ5JW98 314 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM240Q5SV17 173 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 NME8Q8N427 588 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CEP170P1Q96L14 293 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 9.4
PXDC1-201ENST00000380277 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 STK24Q9Y6E0 443 aa16.58■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 PP2D1A8MPX8 630 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CXCL10P02778 98 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CLCN3P51790 818 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SHHQ15465 462 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 IER5Q5VY09 327 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SHC4Q6S5L8 630 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF365Q70YC5 407 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 PPME1Q9Y570 386 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.57■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MUTP22033 750 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 TMOD1P28289 359 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CDC25AP30304 524 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 ECM1Q16610 540 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 KRT79Q5XKE5 535 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 POTEGQ6S5H5 508 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 ANKEF1Q9NU02 776 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 KAT6AQ92794 2004 aa16.56■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 A0A087WWV3 80 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 M0QZ92 97 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 FGBP02675 491 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 XKR9Q5GH70 373 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 NACC1Q96RE7 527 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MAP7D2Q96T17 732 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 WDR81Q562E7 1941 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 IKBKBO14920 756 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 RFC5P40937 340 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 RARRES1P49788 294 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 DRP2Q13474 957 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.55■□□□□ 0.24
PXDC1-201ENST00000380277 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms