RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 NFIBO00712 420 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MAPK7Q13164 816 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SRLQ86TD4 932 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 TAF4BQ92750 862 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 COL20A1Q9P218 1284 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 TGFB2P61812 414 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 C8orf74Q6P047 294 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PACSIN1Q9BY11 444 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 STIM2Q9P246 746 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SOX5P35711 763 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MTMR1Q13613 665 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PSMB7Q99436 277 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 FTCDO95954 541 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 IVLP07476 585 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 H2AFZP0C0S5 128 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ALAS1P13196 640 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 LMNB1P20700 586 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 BAG6P46379 1132 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CYP2J2P51589 502 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 H2AFVQ71UI9 128 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 C12orf56Q8IXR9 622 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 DAW1Q8N136 415 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 TEPSINQ96N21 525 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 VPS18Q9P253 973 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 F8VZ95 297 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 K7ENM7 598 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 EXOC3O60645 756 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 KRT13P13646 458 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 GYS2P54840 703 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 NPEPPSP55786 919 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MYL7Q01449 175 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 BFSP1Q12934 665 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 COG2Q14746 738 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RPS6KA1Q15418 735 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 EMBQ6PCB8 327 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PBKQ96KB5 322 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ACCSQ96QU6 501 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 IWS1Q96ST2 819 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MYH11P35749 1972 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ZBED4O75132 1171 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RPS6KA5O75582 802 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 PLS3P13797 630 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 JAK3P52333 1124 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 EPHB4P54760 987 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SYCE1Q8N0S2 351 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 IL31RAQ8NI17 732 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 UTRNP46939 3433 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 P4HA2O15460 535 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ZMYND10O75800 440 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CLSTN1O94985 981 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SFNP31947 248 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RARRES1P49788 294 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CETN1Q12798 172 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 IFT20Q8IY31 132 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CPXCR1Q8N123 301 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 DNAJC12Q9UKB3 198 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 SAMM50Q9Y512 469 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 MAPK13O15264 365 aa18.46■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 EVI5O60447 810 aa18.46■□□□□ 0.55
PRRX1-202ENST00000367760 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms