RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCC12Q96J65 1359 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL18A1P39060 1754 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 MST1RQ04912 1400 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK7P49862 253 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTK7Q13308 1070 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA24Q86W54 205 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 RETREG2Q8NC44 543 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 LPIN2Q92539 896 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFT74Q96LB3 600 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT23Q9C075 422 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ALS2Q96Q42 1657 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC5A1P13866 664 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 GM2AP17900 193 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT9P35527 623 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT2P35908 639 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 TREML1Q86YW5 311 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYDC2Q96IM9 177 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNCQ9H7C4 482 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRGBPQ9NV56 204 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDP2Q9P2J9 529 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYPNQ86TC9 1320 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPEF2Q9C093 1822 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RGL2O15211 777 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 STARD3NLO95772 234 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCR3P51677 355 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPA2P54652 639 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL17AQ16552 155 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUSD4Q5VX71 490 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLC3Q6P597 504 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIX5Q8N196 739 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 STK36Q9NRP7 1315 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL6A2P12110 1019 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF131P52739 623 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTP1P59025 263 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 HERVK_113P62684 666 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBXN1Q04323 297 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC38Q5R3I4 469 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF333Q96JL9 665 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE8AO60658 829 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASMTLO95671 621 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYP2D6P10635 497 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF844Q08AG5 666 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 LIN52Q52LA3 116 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC43Q8N309 656 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOC1Q9NV70 894 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 POTEFA5A3E0 1075 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RCCD1A6NED2 376 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 E7ENQ6 273 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASAP2O43150 1006 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms