RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.21□□□□□ -0.61
CSAG4-201ENST00000361201 SHDQ96IW2 340 aa11.21□□□□□ -0.61
CSAG4-201ENST00000361201 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CSAG4-201ENST00000361201 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.21□□□□□ -0.61
CSAG4-201ENST00000361201 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.21□□□□□ -0.61
CSAG4-201ENST00000361201 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ORC4O43929 436 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 INSRRP14616 1297 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MARK3P27448 753 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MAGEA9P43362 315 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PRKCQQ04759 706 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 NEDD9Q14511 834 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FGF14Q92915 247 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.2□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CLUHO75153 1309 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.628e-6■■□□□ 13.7
CSAG4-201ENST00000361201 IGBP1P78318 339 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 STPG1Q5TH74 334 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC43Q8N309 656 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PCYT2Q99447 389 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.19□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 KALRNO60229 2985 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MYH6P13533 1939 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 DENND3A2RUS2 1198 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ATP9AO75110 1047 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RLBP1P12271 317 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CA8P35219 290 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 BCAR1P56945 870 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 KRT76Q01546 638 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SP4Q02446 784 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FOXC1Q12948 553 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PARM1Q6UWI2 310 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PDZD3Q86UT5 571 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 NAPBQ9H115 298 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RAB23Q9ULC3 237 aa11.18□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RPS6KA5O75582 802 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RFPL2O75678 378 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CCND2P30279 289 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 GIT2Q14161 759 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FAM228AQ86W67 206 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 BCL11AQ9H165 835 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.17□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 PLCB4Q15147 1175 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CSAG4-201ENST00000361201 NME8Q8N427 588 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms