RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PAMP19021 973 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 COASYQ13057 564 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 TTC17Q96AE7 1141 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 SLC13A4Q9UKG4 626 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 ZBBXA8MT70 800 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 PEX19P40855 299 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 DRP2Q13474 957 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 UBE4BO95155 1302 aa23.95■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 POTEGQ6S5H5 508 aa23.93■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 BEST2Q8NFU1 509 aa23.93■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 DPYSL4O14531 572 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 SNX19Q92543 992 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.91■■□□□ 1.42
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