RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 C12orf60Q5U649 245 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SPATA21Q7Z572 469 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 HIP1RO75146 1068 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 LINGO3P0C6S8 592 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TSPY3P0CV98 308 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TSPY8P0CW00 308 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 FERP16591 822 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 CHRNA3P32297 505 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SNX24Q9Y343 169 aa20.88■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.933e-16■■■■□ 21.3
NOP56-201ENST00000329276 RIPK2O43353 540 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TMEM253P0C7T8 217 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PPATQ06203 517 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.938e-8■■■■□ 19.5
NOP56-201ENST00000329276 PLS1Q14651 629 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 LRRC42Q9Y546 428 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PHF2O75151 1096 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 NR2F2P24468 414 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PDE6BP35913 854 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ABL2P42684 1182 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 GALCP54803 685 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 HYIQ5T013 277 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 GLG1Q92896 1179 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.87■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SLC37A4O43826 429 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 LMNB1P20700 586 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 RNF43Q68DV7 783 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 A8MUI8 341 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ATP4AP20648 1035 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TRAF1Q13077 416 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 BARGINQ6ZT62 677 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 FITM2Q8N6M3 262 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 FBF1Q8TES7 1133 aa20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ITGB4P16144 1822 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 USP17L3A6NCW0 530 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 USP17L4A6NCW7 530 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SLC26A4O43511 780 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ATP5HO75947 161 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 USP17L8P0C7I0 530 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PARP6Q2NL67 630 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 MFN1Q8IWA4 741 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 MXD3Q9BW11 206 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 STX8Q9UNK0 236 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PHLPP1O60346 1717 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 UNC5CO95185 931 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 PTGIRP43119 386 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 ACVR2BQ13705 512 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NOP56-201ENST00000329276 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.3 ms