RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 CCND2P30279 289 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 DSG3P32926 999 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PLS1Q14651 629 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CREG2Q8IUH2 290 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TSKSQ9UJT2 592 aa23.75■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ACCSQ96QU6 501 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 MYH11P35749 1972 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 MCM3P25205 808 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ABCB6Q9NP58 842 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 FZD1Q9UP38 647 aa23.74■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CCNE2O96020 404 aa23.73■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 KLRC1P26715 233 aa23.73■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 UGCGQ16739 394 aa23.73■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 GPRASP2Q96D09 838 aa23.73■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 MAFGO15525 162 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 NR3C2P08235 984 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 NLRX1Q86UT6 975 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 VPS36Q86VN1 386 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 RDM1Q8NG50 284 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 COG1Q8WTW3 980 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 KLRG1Q96E93 195 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 BACH1O14867 736 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 STAT1P42224 750 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 BFSP1Q12934 665 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 GJB7Q6PEY0 223 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TLR10Q9BXR5 811 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PARP14Q460N5 1801 aa23.72■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 MAP2K7O14733 419 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 FERP16591 822 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ITIH3Q06033 890 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CBWD6Q4V339 395 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 HDXQ7Z353 690 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PALMO75781 387 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM49P0CI25 452 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM49CP0CI26 452 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 KRT13P13646 458 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 GGA3Q9NZ52 723 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 NAGPAQ9UK23 515 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 L1RE1Q9UN81 338 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.71■■□□□ 1.39
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM150BA6NC51 233 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 ATP2A1O14983 1001 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 NCK2O43639 380 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 GTF2BQ00403 316 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 XKR9Q5GH70 373 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 RDH13Q8NBN7 331 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 IWS1Q96ST2 819 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 STK33Q9BYT3 514 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.7■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 MYL7Q01449 175 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC181Q5TID7 509 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 ST7Q9NRC1 585 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 PAFAH1B1P43034 410 aa23.69■■□□□ 1.38
SPHK1-201ENST00000323374 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms