RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM54-201ENST00000296098 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 WDR64B1ANS9 1081 aa26.12■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.12■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.1■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 RIPK3Q9Y572 518 aa26.1■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM150BA6NC51 233 aa26.09■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa26.09■■□□□ 1.77
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