RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 MIER3Q7Z3K6 550 aa16.17■□□□□ 0.18
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CASC3-201ENST00000264645 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.16■□□□□ 0.18
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CASC3-201ENST00000264645 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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CASC3-201ENST00000264645 TEKT1Q969V4 418 aa16.15■□□□□ 0.18
CASC3-201ENST00000264645 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.15■□□□□ 0.18
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CASC3-201ENST00000264645 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.15■□□□□ 0.18
CASC3-201ENST00000264645 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.15■□□□□ 0.18
CASC3-201ENST00000264645 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.15■□□□□ 0.18
CASC3-201ENST00000264645 SHPRHQ149N8 1683 aa16.14■□□□□ 0.18
CASC3-201ENST00000264645 F8VZ95 297 aa16.14■□□□□ 0.17
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