RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 RPAINQ86UA6 219 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF592Q92610 1267 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 EDAQ92838 391 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC17Q96LX7 622 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 AIFM3Q96NN9 605 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD9AQ99638 391 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MYL10Q9BUA6 226 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAD9Q9H845 621 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF146Q9NTX7 359 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L12C9JPN9 530 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L21D6R901 530 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 H0Y858 1186 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP6O43182 974 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NBNO60934 754 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT37O76014 449 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LTBRP36941 435 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAP25P60880 206 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCZ1BP86790 482 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NCAPHQ15003 741 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPROQ16827 1216 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LONRF3Q496Y0 759 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 EPC2Q52LR7 807 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf60Q5U649 245 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT17Q6IS24 598 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 HOMER1Q86YM7 354 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 VSTM4Q8IW00 320 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL6Q8N531 539 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 IQUBQ8NA54 791 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD7Q92527 254 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CLIC6Q96NY7 704 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KAT14Q9H8E8 782 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SENP2Q9HC62 589 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TLR9Q9NR96 1032 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 RMND1Q9NWS8 449 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9Y3F1 56 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA1GO43497 2377 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPY2A6NKD2 308 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 STXBP3O00186 592 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MBTPS2O43462 519 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SLFN14P0C7P3 912 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ALAS1P13196 640 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SELPP16109 830 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CPT1AP50416 773 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP5P59047 1200 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG1Q07617 926 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GPM6BQ13491 265 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MORC3Q14149 939 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGISQ16647 500 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CTR9Q6PD62 1173 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 COPS5Q92905 334 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GSDMAQ96QA5 445 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRX2Q99811 253 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 VTA1Q9NP79 307 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 INCENPQ9NQS7 918 aa7.84□□□□□ -1.15
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