RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 GHRP10912 638 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PLCG1P19174 1290 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 GPC3P51654 580 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SHHQ15465 462 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TCTN1Q2MV58 587 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PADI6Q6TGC4 694 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SZT2Q5T011 3432 aa24.2■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 TDHQ8IZJ6 230 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 OSMRQ99650 979 aa24.2■■□□□ 1.46
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SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH11P35749 1972 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CUTAO60888 179 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ME1P48163 572 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 KSR1Q8IVT5 923 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA32Q96LK8 384 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SQORQ9Y6N5 450 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPRSQ13332 1948 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 FGBP02675 491 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP11B2P19099 503 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SHC4Q6S5L8 630 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 TCP11Q8WWU5 503 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 TXLNAP40222 546 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RASIP1Q5U651 963 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A087X0B3 334 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PPC1 479 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ARL2P36404 184 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC12A3P55017 1021 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 USP38Q8NB14 1042 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 HERVK_113Q902F9 699 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 PLA2G4BP0C869 781 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CD52P31358 61 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC42EP1Q00587 391 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF410Q86VK4 478 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRP7Q8WX94 980 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRP4Q96MN2 994 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A087WZ62 844 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SEPT8Q92599 483 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SCLT1Q96NL6 688 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 PADI3Q9ULW8 664 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 ACTN1P12814 892 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 GLRA2P23416 452 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 RAD54LQ92698 747 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 TTC3P53804 2025 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ASAP2O43150 1006 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RPS6KA5O75582 802 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 BAIAP3O94812 1187 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RESP18Q5W5W9 173 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM228AQ86W67 206 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF149Q8NC42 400 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 APBB2Q92870 758 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 POLD4Q9HCU8 107 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 STK17AQ9UEE5 414 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 CDH23Q9H251 3354 aa24.13■■□□□ 1.45
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