RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053785.9

Trpc1-201, Transcript of Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trpc1, Length 2,912 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ndufv1Q91YT0 464 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cfap44E9Q5M6 1843 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gimap9G3X987 291 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pdk4O70571 412 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Galnt17Q7TT15 598 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Actl9Q8CG27 415 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 DccP70211 1447 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PrlP06879 226 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gbp1Q01514 589 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Oca2Q62052 833 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 AacsQ9D2R0 672 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pard6bQ9JK83 371 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Arl6ip4Q9JM93 229 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 March10E9PX79 788 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Palb2Q3U0P1 1104 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 LrmpQ60664 539 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 ItpkaQ8R071 459 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kbtbd4Q8R179 534 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dbndd1Q9CZ00 160 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tex13cD3YU32 604 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gsg1l2M0QWL6 290 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Flot1O08917 428 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pex5O09012 639 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Fgd3O88842 733 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Krt9Q6RHW0 743 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Igdcc3Q8BQC3 813 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Zfp449Q8CB76 518 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mzb1Q9D8I1 188 aa21.52■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Epha3P29319 983 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Serping1P97290 504 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dpcr1Q3TNW5 500 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ndufaf2Q59J78 168 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 TdrkhQ80VL1 560 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Myl6bQ8CI43 207 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Klc3Q91W40 508 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tex19.1Q99MV2 351 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Rasgef1cQ9D300 466 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 AuhQ9JLZ3 314 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 CraddO88843 199 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Snai1Q02085 264 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Llgl1Q80Y17 1036 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Lrrc8cQ8R502 803 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kat2aQ9JHD2 830 aa21.51■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Scg2Q03517 617 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Smcr8Q3UMB5 935 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 March6Q6ZQ89 909 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Rimbp2Q80U40 1072 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ror2Q9Z138 944 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Krt27Q9Z320 448 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Chil3O35744 398 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Stmn4P63042 189 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nudt13Q8JZU0 352 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mad2l2Q9D752 211 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PappaQ8R4K8 1624 aa21.5■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PtenO08586 403 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Serpinc1P32261 465 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 MlxipQ2VPU4 917 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 4921504E06RikQ8CET2 560 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Uba5Q8VE47 403 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 GnaqP21279 359 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Akr1b1P45376 316 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Wfs1P56695 890 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Muc3aQ3U5A2 218 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ell2Q3UKU1 639 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sin3bQ62141 1098 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mcf2lQ64096 1149 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Jade3Q6IE82 823 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gimap8Q75N62 688 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Enoph1Q8BGB7 257 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ccser1Q8C0C4 895 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Q8R1Y2 203 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tpp2Q64514 1262 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nlrp4eQ66X19 978 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ccdc15Q8C9M2 810 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Bbs7Q8K2G4 715 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Rev1Q920Q2 1249 aa21.49■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm1141B9EJU1 475 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 H2afzP0C0S6 128 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Eef2P58252 858 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 H2afvQ3THW5 128 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mpp4Q6P7F1 635 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PodnQ7TQ62 611 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Znf367Q0VDT2 340 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Fam183bQ5NC57 135 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Atp4aQ64436 1033 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Parp6Q6P6P7 630 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.9 ms