RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm1587Q3UT80 123 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sema4bQ62179 823 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tgoln2Q62314 363 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ppp1r13bQ62415 1087 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tex21Q9R0U9 575 aa16.08■□□□□ 0.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Trip11E9Q512 1976 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tanc1Q0VGY8 1856 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm45194A0A140LJG2 572 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn2r79E9Q067 851 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fgfr4Q03142 799 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 P4ha1Q60715 534 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Exoc3Q6KAR6 755 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rpap3Q9D706 660 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Limd1Q9QXD8 668 aa16.08■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Skor2A7M7C7 1008 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm5934D3Z4U6 212 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Heatr4E9Q357 955 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm10378F6XQQ1 160 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Serpina1aP07758 413 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pgk2P09041 417 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Serpina1bP22599 413 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Capza3P70190 299 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Serpina1cQ00896 412 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Serpina1dQ00897 413 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cfap52Q5F201 620 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Papd7Q6PB75 542 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Psmd2Q8VDM4 908 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Adcy3Q8VHH7 1145 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Myh11O08638 1972 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Apol10bG3X9K7 334 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ube3aO08759 870 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dnajc17Q91WT4 303 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 CoasyQ9DBL7 563 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sucla2Q9Z2I9 463 aa16.07■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cd70O55237 195 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Snx12O70493 165 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 P4hbP09103 509 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PrkceP16054 737 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nploc4P60670 608 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pstpip1P97814 415 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ppp1r7Q3UM45 361 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vipas39Q8BGQ1 491 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cep95Q8BVV7 827 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam20aQ8CID3 541 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Stap2Q8R0L1 411 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ivns1abpQ920Q8 642 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ribc1Q9D0B8 379 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sh2b2Q9JID9 621 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm4985A2ALC6 410 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 1700018F24RikB2RW27 314 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Trdmt1O55055 415 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Il2rbP16297 539 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ly9Q01965 654 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rsad1Q5SUV1 442 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sycp1Q62209 993 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Me2Q99KE1 589 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tas1r1Q99PG6 842 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Hebp1Q9R257 190 aa16.06■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ppef1O35655 650 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Apba3O88888 571 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ano9P86044 747 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tarbp2P97473 365 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zfp943Q6NZP4 507 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lrsam1Q80ZI6 727 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 CutaQ9CQ89 177 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Snx10Q9CWT3 201 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nudt12Q9DCN1 462 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pex11aQ9Z211 246 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sbno2Q7TNB8 1349 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc12a2P55012 1205 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Znf354cQ571J5 560 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam183bQ5NC57 135 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rtp1Q8C8C1 263 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rbm41Q8JZV4 413 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 EpgnQ924X1 152 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mxra8Q9DBV4 442 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Atad5Q4QY64 1826 aa16.05■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Folh1O35409 752 aa16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gfpt1P47856 697 aa16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PtgdrP70263 357 aa16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 EtnpplQ8BWU8 499 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms