RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 GPR20Q99678 358 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 GDAQ9Y2T3 454 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 HMGCRP04035 888 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 RBL2Q08999 1139 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ADSSL1Q8N142 457 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 ZBTB39O15060 712 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 RAD54LQ92698 747 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 STK17AQ9UEE5 414 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 DNM3Q9UQ16 869 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 KCNJ18B7U540 433 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 AKR1A1P14550 325 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 KCNJ12Q14500 433 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 CNGA4Q8IV77 575 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 CCDC51Q96ER9 411 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NACC1Q96RE7 527 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 PCYT2Q99447 389 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ZNF302Q9NR11 478 aa22.02■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 PPTC7Q8NI37 304 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.01■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 TRIM14Q14142 442 aa22.01■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 TLK2Q86UE8 772 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 C4orf19Q8IY42 314 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.01■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.01■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 PSMA7O14818 248 aa22■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 SEPT4O43236 478 aa22■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.99■■□□□ 1.11
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CLN8-208ENST00000635751 ARID3AQ99856 593 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 VPS16Q9H269 839 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 THAP9Q9H5L6 903 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 AZI2Q9H6S1 392 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 KAT6AQ92794 2004 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 MYH11P35749 1972 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
CLN8-208ENST00000635751 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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