RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-215ENST00000626257 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 TBC1D12O60347 775 aa28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 FLOT1O75955 427 aa28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 ANXA13P27216 316 aa28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 EPHB4P54760 987 aa28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 ODF2LQ9ULJ1 636 aa28.77■■■□□ 2.2
CCZ1B-215ENST00000626257 NENFQ9UMX5 172 aa28.77■■■□□ 2.2
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CCZ1B-215ENST00000626257 ACTN2P35609 894 aa28.76■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 CAP2P40123 477 aa28.76■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.76■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.74■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.74■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.74■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.74■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 CYP2J2P51589 502 aa28.73■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 LRRC57Q8N9N7 239 aa28.73■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 GOLPH3Q9H4A6 298 aa28.73■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 COL4A5P29400 1685 aa28.73■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 TTLL6Q8N841 843 aa28.73■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 PTGER2P43116 358 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 USP38Q8NB14 1042 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 HIP1RO75146 1068 aa28.71■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 EVI5O60447 810 aa28.7■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.7■■■□□ 2.19
CCZ1B-215ENST00000626257 DAW1Q8N136 415 aa28.7■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 COL20A1Q9P218 1284 aa28.7■■■□□ 2.19
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CCZ1B-215ENST00000626257 F8VZ95 297 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 ICAM1P05362 532 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 SOX5P35711 763 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 STRA6Q9BX79 667 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 STK33Q9BYT3 514 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 PPP1R37O75864 691 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1B-215ENST00000626257 TRIM49P0CI25 452 aa28.69■■■□□ 2.18
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