RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 VTNP04004 478 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PSAPP07602 524 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 GNA11P29992 359 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 CIITAP33076 1130 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 COASYQ13057 564 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PRR16Q569H4 304 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 BRF1Q92994 677 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 RNF135Q8IUD6 432 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 GLP2RO95838 553 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 DSC3Q14574 896 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL16Q8N461 479 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PHKBQ93100 1093 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 LENG9Q96B70 501 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TLE6Q9H808 572 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB2O15479 319 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FGF18O76093 207 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 TLR9Q9NR96 1032 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 HCSTQ9UBK5 93 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FGFR1P11362 822 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 HSPA4P34932 840 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 NTRK3Q16288 839 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01465Q8N7H1 131 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 BICD2Q8TD16 824 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FAM167AQ96KS9 214 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 CWH43Q9H720 699 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 SAMM50Q9Y512 469 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 EDIL3O43854 480 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 CLCN3P51790 818 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 ERVFC1P60507 584 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 THNSL1Q8IYQ7 743 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 WDR64B1ANS9 1081 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 PER2O15055 1255 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 EFCAB12Q6NXP0 572 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 AKT3Q9Y243 479 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF862O60290 1169 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 LAG3P18627 525 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KB1P23443 525 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 TMOD1P28289 359 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 MAP7D2Q96T17 732 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 KCNH6Q9H252 994 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 DISC1Q9NRI5 854 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 TECTAO75443 2155 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 FSD2A1L4K1 749 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 FSCN2O14926 492 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 MSH4O15457 936 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 OATP04181 439 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 IFNAR1P17181 557 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP6Q16828 381 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC71Q8N4P6 559 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 EDAQ92838 391 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 RNF19AQ9NV58 838 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 LZTS1Q9Y250 596 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 HOXA2O43364 376 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 USP11P51784 963 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 PLCB3Q01970 1234 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms