RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 AOC1P19801 751 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF76P36508 570 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR3Q13615 1198 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RUBCNQ92622 972 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 S1PR5Q9H228 398 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PXMP2Q9NR77 195 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MAFGO15525 162 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KPNA6O60684 536 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 USP11P51784 963 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MCTP1Q6DN14 999 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SCFD2Q8WU76 684 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ANO3Q9BYT9 981 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 R4GN57 208 aa8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 EMSYQ7Z589 1322 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KALRNO60229 2985 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MEIS2O14770 477 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 OPLAHO14841 1288 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PPFIA3O75145 1194 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NR3C2P08235 984 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TGFB3P10600 412 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SREBF1P36956 1147 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NRIP1P48552 1158 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TRAPPC10P48553 1259 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ST3GAL1Q11201 340 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KCNC3Q14003 757 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 HIC1Q14526 733 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2SQ16763 222 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 BRAPQ7Z569 592 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 COPS5Q92905 334 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PLVAPQ9BX97 442 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.81□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KAT6AQ92794 2004 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FIBPO43427 364 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MARCH6O60337 910 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 UPP2O95045 317 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CSPG5O95196 566 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 BMP15O95972 392 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 EDNRBP24530 442 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGAP4P98171 946 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PTK7Q13308 1070 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PGM5Q15124 567 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NEK8Q86SG6 692 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB33Q86T24 672 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FIBCD1Q8N539 461 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 P2RX5Q93086 422 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 GPRASP2Q96D09 838 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms