RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52Z1P0C646 297 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PSEN2P49810 448 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZXDAP98168 799 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 HYAL1Q12794 435 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGDRQ13258 359 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC39A14Q15043 492 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RIT2Q99578 217 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D22BQ9NU19 505 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A6Q14031 1691 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MSH4O15457 936 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH6O60337 910 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NFASCO94856 1347 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NEDD9Q14511 834 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 STK38Q15208 465 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPAQ15257 358 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 LY6KQ17RY6 165 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC5A5Q92911 643 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR9Q96QG7 549 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 LMAN2LQ9H0V9 348 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CD207Q9UJ71 328 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIC4Q9Y696 253 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.51■■□□□ 1.83
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CAPNS1-214ENST00000592483 RSPH10BP0C881 870 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ARP10275 920 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA3FQ13275 785 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 HAS3O00219 553 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP6R2O75170 966 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RB1P06400 928 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD10Q14728 455 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SDF4Q9BRK5 362 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-214ENST00000592483 TBX10O75333 385 aa26.49■■□□□ 1.83
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CAPNS1-214ENST00000592483 F2P00734 622 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNA2P16389 499 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 HAS1Q92839 578 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GBP4Q96PP9 640 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB34Q9BZG1 259 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTLC2O15270 562 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 THPOP40225 353 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT8Q92599 483 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA32Q96LK8 384 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM6O15303 877 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS7O60861 476 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD10O75832 226 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 EYA4O95677 639 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CTNNB1P35222 781 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ERMP1Q7Z2K6 904 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SERINC5Q86VE9 423 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM186AA6NE01 2351 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PROB1E7EW31 1015 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 BMPR1AP36894 532 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT76Q01546 638 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM15Q13444 863 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL7BQ6UX53 244 aa26.46■■□□□ 1.83
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