RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FGFR1	P11362	822 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	LAG3	P18627	525 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CA8	P35219	290 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	NHLH1	Q02575	133 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FUT2	Q10981	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PRR16	Q569H4	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326		M0R296	226 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MAGEB2	O15479	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	HOXA2	O43364	376 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	GLP2R	O95838	553 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CYP3A4	P08684	503 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ATP4A	P20648	1035 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TMOD1	P28289	359 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	GNA11	P29992	359 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CLCN3	P51790	818 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ERVFC1	P60507	584 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	DUSP6	Q16828	381 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB33	Q86T24	672 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RASEF	Q8IZ41	740 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	GPR32	O75388	356 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	CPA1	P15085	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TEC	P42680	631 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ZXDA	P98168	799 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	KRT17	Q04695	432 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326		Q6ZUG5	572 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TCF25	Q9BQ70	676 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	CWH43	Q9H720	699 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TTC3	P53804	2025 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	CHMP2A	O43633	222 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	HSPA4	P34932	840 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	RCAN1	P53805	252 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	FAM189B	P81408	668 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	BICD2	Q8TD16	824 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	KCNB2	Q92953	911 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	BRF1	Q92994	677 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ESYT2	A0FGR8	921 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	FSCN2	O14926	492 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	GAS7	O60861	476 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	OAT	P04181	439 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
USP36-223	ENST00000592326	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37

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