RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	RTN1	Q16799	776 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	ZBTB43	O43298	467 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	TEC	P42680	631 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	CWH43	Q9H720	699 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	COL1A2	P08123	1366 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	FSCN2	O14926	492 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	C22orf31	O95567	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	PBX3	P40426	434 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	PTPN5	P54829	565 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SUSD6	Q92537	303 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC1-208	ENST00000576557	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR32	O75388	356 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	LAG3	P18627	525 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CDC27	P30260	824 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CLCN3	P51790	818 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ANAPC15	P60006	121 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM189B	P81408	668 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TCF15	Q12870	199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KRT32	Q14532	448 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	DSC3	Q14574	896 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PKN1	Q16512	942 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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