RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569298.1

KARS-211, Transcript of lysyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 2

Gene KARS, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARS-211ENST00000569298 EPHB4P54760 987 aa7□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KARS-211ENST00000569298 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 STK17AQ9UEE5 414 aa7□□□□□ -1.29
KARS-211ENST00000569298 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 PTPRTO14522 1441 aa7□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 WDR17Q8IZU2 1322 aa7□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 14.3
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KARS-211ENST00000569298 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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KARS-211ENST00000569298 CFAP36Q96G28 342 aa6.99□□□□□ -1.29
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