RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.36■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.36■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MYBL2P10244 700 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 PAFAH1B1P43034 410 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 RASA3Q14644 834 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 DMAC2Q9NW81 257 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 HIP1RO75146 1068 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MAPK7Q13164 816 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 RUBCNQ92622 972 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 LRRC1Q9BTT6 524 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 FTCDO95954 541 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GHRHRQ02643 423 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GJB7Q6PEY0 223 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 DAW1Q8N136 415 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB9Q96C00 473 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 ANXA13P27216 316 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 GYS2P54840 703 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 LPAR1Q92633 364 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 STRA6Q9BX79 667 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 NENFQ9UMX5 172 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R37O75864 691 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CYP2J2P51589 502 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TKFCQ3LXA3 575 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MS4A14Q96JA4 679 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TEPSINQ96N21 525 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 RNF14Q9UBS8 474 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 NAGPAQ9UK23 515 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ALAS1P13196 640 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FMO5P49326 533 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TNIP1Q15025 636 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PADI6Q6TGC4 694 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CPXCR1Q8N123 301 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DGKZQ13574 1117 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 POTEAQ6S8J7 498 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CCDC102AQ96A19 550 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 VPS18Q9P253 973 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FAM71BQ8TC56 605 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ATP8B3O60423 1300 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FLOT1O75955 427 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FERP16591 822 aa25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ERICH4A6NGS2 130 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 STAT1P42224 750 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PPP2R5AQ15172 486 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 EXOC4Q96A65 974 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MED4Q9NPJ6 270 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PIM2Q9P1W9 311 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 K7ENM7 598 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 EGFRP00533 1210 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DNA2P51530 1060 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 VPS36Q86VN1 386 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms