RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 STX6O43752 255 aa24.19■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 MED24O75448 989 aa24.19■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 RESTQ13127 1097 aa24.19■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 IL17AQ16552 155 aa24.19■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.19■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.19■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.18■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.18■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 GINS2Q9Y248 185 aa24.18■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 RFC5P40937 340 aa24.17■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 DNM2P50570 870 aa24.17■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.16■■□□□ 1.46
NME3-210ENST00000567271 OSMRQ99650 979 aa24.16■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 RAB30Q15771 203 aa24.15■■□□□ 1.46
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NME3-210ENST00000567271 TIFAQ96CG3 184 aa24.14■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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NME3-210ENST00000567271 Q7L0L9 218 aa24.13■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.13■■□□□ 1.45
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NME3-210ENST00000567271 PP2D1A8MPX8 630 aa24.12■■□□□ 1.45
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NME3-210ENST00000567271 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 KRT79Q5XKE5 535 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 DEFB123Q8N688 67 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 NLRP7Q8WX94 980 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TMEM143Q96AN5 459 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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