RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMOD1P28289 359 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDIT3P35638 169 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 RARRES1P49788 294 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHHQ15465 462 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM240Q5SV17 173 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 IER5Q5VY09 327 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF365Q70YC5 407 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIC6Q96NY7 704 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSRNP2Q9H175 543 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKT3Q9Y243 479 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MUTP22033 750 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPECC1Q5M775 1068 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 AK8Q96MA6 479 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 GINS2Q9Y248 185 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 M0QZ92 97 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFC5P40937 340 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CABP7Q86V35 215 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP7D2Q96T17 732 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLIN2Q99541 437 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPME1Q9Y570 386 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCHHQ07283 1943 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPTLC2O15270 562 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGBP02675 491 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL10P02778 98 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBA7P41226 1012 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIZQ2M2Z5 673 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDHQ8IZJ6 230 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA5Q96PV4 448 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 E9PMD0 336 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 YEATS4O95619 227 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFKMP08237 780 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 GHRP10912 638 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNM2P50570 870 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRB10Q13322 594 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 EMC2Q15006 297 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATL3Q6DD88 541 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP49Q70CQ1 688 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNK18Q7Z418 384 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM143Q96AN5 459 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPSTI1Q96J88 318 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUCB2P80303 420 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPIN1Q14693 890 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCTN1Q2MV58 587 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 HYIQ5T013 277 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP45Q9UL16 551 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNM3Q9UQ16 869 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR32O75388 356 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTRQ99707 1265 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP6R2O75170 966 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 DGAT1O75907 488 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KSR1Q8IVT5 923 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSMRQ99650 979 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPC3P51654 580 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PADI6Q6TGC4 694 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms