RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 HUNKP57058 714 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNGT1P63211 74 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ICA1Q05084 483 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC181Q5TID7 509 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD302Q8IX05 232 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERMNQ8TAM6 284 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 BUB1O43683 1085 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXCR5P32302 372 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPAINQ86UA6 219 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSRNP1Q96S65 589 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMB7Q99436 277 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSKSQ9UJT2 592 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 F5H6K3 240 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSBPO95073 299 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPA1P27694 616 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLRC3Q07444 240 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GIT2Q14161 759 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 LENG9Q96B70 501 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GANQ9H2C0 597 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 NR2F2P24468 414 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAFAH1B1P43034 410 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASP5P51878 434 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNAP25P60880 206 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMC6P62333 389 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNH2Q12809 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRM1Q13255 1194 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC18A3Q16572 532 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO11Q86XK2 927 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNM3Q9UQ16 869 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTOFQ9HC10 1997 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 INPP5BP32019 993 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SREBF1P36956 1147 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTMPQ5BVD1 217 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D5Q92609 795 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMCL1Q96IK5 515 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHD2Q9NZN4 543 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK24Q9Y6E0 443 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM86B1E9PN63 330 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSF2BPO75031 334 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAB2Q15742 525 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQCKQ8N0W5 287 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 REEP2Q9BRK0 252 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCNTO95613 3336 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEIS1O00470 390 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FNTAP49354 379 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASIC2Q16515 512 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 USH1GQ495M9 461 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SFR1Q86XK3 245 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM20AQ96MK3 541 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GDF3Q9NR23 364 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 GDF11O95390 407 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 NDUFB10O96000 172 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 LIG3P49916 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CIITAP33076 1130 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXD13P35453 343 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARID5AQ03989 594 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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