RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYPNQ86TC9 1320 aa23.33■■□□□ 1.32
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRKCIP41743 596 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS36Q86VN1 386 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KSR1Q8IVT5 923 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPC2Q8N158 579 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIX2Q9NPC8 291 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RIPK3Q9Y572 518 aa23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EXOC3O60645 756 aa23.32■■□□□ 1.32
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