RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-215	ENST00000561436	MAN2B1	O00754	1011 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	GPR39	O43194	453 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FKBP9	O95302	570 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	IRF9	Q00978	393 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	DSG1	Q02413	1049 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SEC23A	Q15436	765 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CPZ	Q66K79	652 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NXPE1	Q8N323	547 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		5	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TRAF5	O00463	557 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NEMP1	O14524	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EYA4	O95677	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NOBOX	O60393	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FAH	P16930	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CNR2	P34972	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SESN3	P58005	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NPAT	Q14207	1427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SCD	O00767	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CYP17A1	P05093	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF28	P17035	718 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	MC4R	P32245	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	LSP1	P33241	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	KIF11	P52732	1056 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EVA1C	P58658	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	PFKP	Q01813	784 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ITK	Q08881	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NFIX	Q14938	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	DDB1	Q16531	1140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	NME9	Q86XW9	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC1-215	ENST00000561436	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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