RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 DRP2Q13474 957 aa23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 USP38Q8NB14 1042 aa23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 CEP170P1Q96L14 293 aa23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 FAM161BQ96MY7 647 aa23.42■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.42■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 GPR32O75388 356 aa23.41■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.41■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.41■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 LAD1O00515 517 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 AMHP03971 560 aa23.4■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 SYT1P21579 422 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 FERMT3Q86UX7 667 aa23.4■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 PADI3Q9ULW8 664 aa23.4■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.4■■□□□ 1.34
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRSQ13332 1948 aa23.39■■□□□ 1.34
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TMOD3-203ENST00000558455 XKR9Q5GH70 373 aa23.39■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 BRAPQ7Z569 592 aa23.39■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 ERMNQ8TAM6 284 aa23.39■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.39■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 TLL1O43897 1013 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 MED24O75448 989 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 GJB5O95377 273 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 RFC5P40937 340 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 PRPHP41219 470 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 DNM2P50570 870 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 GPC3P51654 580 aa23.38■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.38■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.38■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.38■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 IL17AQ16552 155 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.37■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 GUCD1Q96NT3 240 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.37■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 POTEGQ6S5H5 508 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 FAM228AQ86W67 206 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 NLRP7Q8WX94 980 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 RAB34Q9BZG1 259 aa23.36■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 TMX1Q9H3N1 280 aa23.36■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 ENPP3O14638 875 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 RARRES1P49788 294 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 RESTQ13127 1097 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 PDIA5Q14554 519 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 TOP1MTQ969P6 601 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM143Q96AN5 459 aa23.35■■□□□ 1.33
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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TMOD3-203ENST00000558455 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.34■■□□□ 1.33
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