RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 PTPRSQ13332 1948 aa9.24□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.24□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 COL4A6Q14031 1691 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 C9IYK1 514 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 MBTPS2O43462 519 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 MGEA5O60502 916 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 GPR32O75388 356 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 REC8O95072 547 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 VTNP04004 478 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 RPS6KB1P23443 525 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 DNAJB1P25685 340 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 CIITAP33076 1130 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 NRIP1P48552 1158 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 NDUFV1P49821 464 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 GATMP50440 423 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 USP11P51784 963 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 FAM189BP81408 668 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 EFHBQ8N7U6 833 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 POF1BQ8WVV4 589 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 PHKBQ93100 1093 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 FAM167AQ96KS9 214 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 MAP7D2Q96T17 732 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 TLE6Q9H808 572 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 AKT3Q9Y243 479 aa9.23□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 SIP14410 1827 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 WDR64B1ANS9 1081 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 ADAMTS3O15072 1205 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 LINC01565O15544 149 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 HOXA2O43364 376 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 GAS7O60861 476 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 IFNAR1P17181 557 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 IRS1P35568 1242 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 NLRP5P59047 1200 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 UBE3AQ05086 875 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 RIT2Q99578 217 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 OSMRQ99650 979 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 DISC1Q9NRI5 854 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 KAT6AQ92794 2004 aa9.22□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 TTC3P53804 2025 aa9.21□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
COCH-211ENST00000557065 FSD2A1L4K1 749 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 MSH4O15457 936 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 TBX10O75333 385 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 FGF18O76093 207 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 EYA4O95677 639 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 LAG3P18627 525 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 SFNP31947 248 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 DNM2P50570 870 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 CLCN3P51790 818 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 EVCP57679 992 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 CDC42EP1Q00587 391 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 COASYQ13057 564 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 NTRK3Q16288 839 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 FAM228AQ86W67 206 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 RNF135Q8IUD6 432 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 ABI1Q8IZP0 508 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 SCLT1Q96NL6 688 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 CLEC1BQ9P126 229 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 MYO7AQ13402 2215 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.21□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 CPLX1O14810 134 aa9.2□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 PER2O15055 1255 aa9.2□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 EOMESO95936 686 aa9.2□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 OATP04181 439 aa9.2□□□□□ -0.94
COCH-211ENST00000557065 FGFR1P11362 822 aa9.2□□□□□ -0.94
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