RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 NAPAP54920 295 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTDSP2-204ENST00000548823 SEPT8Q92599 483 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ANO10Q9NW15 660 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTDSP2-204ENST00000548823 EYA4O95677 639 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF286BP0CG31 522 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 CPVLQ9H3G5 476 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 IGFLR1Q9H665 355 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 SMCO2A6NFE2 343 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 ATP2B1P20020 1258 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 BMPR1AP36894 532 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 PROB1E7EW31 1015 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 AVPR2P30518 371 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 HOMER1Q86YM7 354 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 USP25Q9UHP3 1055 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 PLXNA3P51805 1871 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB5O15062 677 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAMTS3O15072 1205 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC01565O15544 149 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC00271P0C7V0 271 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF165P49910 485 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 WNT7AO00755 349 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 PPFIA4O75335 1185 aa22.35■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 NUBP1P53384 320 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 CNNM3Q8NE01 707 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 APBB2Q92870 758 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ASIC4Q96FT7 647 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.33■■□□□ 1.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCY7P51828 1080 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP12P59046 1061 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 USH1GQ495M9 461 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 LONRF3Q496Y0 759 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.33■■□□□ 1.17
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