RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMD10O75832 226 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 RB1P06400 928 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CA3P07451 260 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 GHRP10912 638 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PBX2P40425 430 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 RFC5P40937 340 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKCEQ02156 737 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA7Q15375 998 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT40Q6A162 431 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 HACE1Q8IYU2 909 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ABI1Q8IZP0 508 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FIBCD1Q8N539 461 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NECAB1Q8N987 351 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP7Q8WX94 980 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TOP1MTQ969P6 601 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PHOX2BQ99453 314 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CD320Q9NPF0 282 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 STK39Q9UEW8 545 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 COG5Q9UP83 839 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM50BQ9Y247 325 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 GINS2Q9Y248 185 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 M0R2N6 131 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 UPP2O95045 317 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BMP15O95972 392 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNE2O96020 404 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNA1P02708 482 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MUTP22033 750 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RABGGTBP53611 331 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TFDP1Q14186 410 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf34Q49A92 452 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF410Q86VK4 478 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 C4orf19Q8IY42 314 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LENG9Q96B70 501 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP170P1Q96L14 293 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MBOAT7Q96N66 472 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PCYT2Q99447 389 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PLVAPQ9BX97 442 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST12Q9NRB3 414 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXNA3P51805 1871 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIOO75962 3097 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD18B2RXH4 712 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ENPP3O14638 875 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LPXNO60711 386 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DGAT1O75907 488 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CTDNEP1O95476 244 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TDP2O95551 362 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 C22orf31O95567 290 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EOMESO95936 686 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2B1P20020 1258 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CD52P31358 61 aa6.26□□□□□ -1.41
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