RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PADI6Q6TGC4 694 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RNF180Q86T96 592 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SESTD1Q86VW0 696 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 GPBP1Q86WP2 473 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 STAMQ92783 540 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SPC25Q9HBM1 224 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KCND2Q9NZV8 630 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 COL1A2P08123 1366 aa8.71□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 DGAT1O75907 488 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CABYRO75952 493 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 MYL3P08590 195 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 BMP6P22004 513 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RFC5P40937 340 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 AFMP43652 599 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PNOCQ13519 176 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 GIT2Q14161 759 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CAMK4Q16566 473 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 XKR9Q5GH70 373 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KANK3Q6NY19 840 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SV2BQ7L1I2 683 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 DDX12PQ92771 950 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CEP170P1Q96L14 293 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 FIZ1Q96SL8 496 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 REEP2Q9BRK0 252 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.7□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 A0A0C4DFX4 3053 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PQY0 241 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ZEB2O60315 1214 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RSPH10BP0C881 870 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RTP1P59025 263 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PPFIA1Q13136 1202 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 DRP2Q13474 957 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 EMC2Q15006 297 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 GRIK4Q16099 956 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 MTERF2Q49AM1 385 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 Q7L0L9 218 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 TDHQ8IZJ6 230 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KCNN1Q92952 543 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 TIPINQ9BVW5 301 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SETD4Q9NVD3 440 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 TRPC6Q9Y210 931 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 NRCAMQ92823 1304 aa8.69□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 TCHHQ07283 1943 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 HIP1RO75146 1068 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RHOBTB3O94955 611 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 KLRC1P26715 233 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ARL2P36404 184 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CDK7P50613 346 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 AMPD3Q01432 767 aa8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C16orf62-211ENST00000540101 ITGA7Q13683 1181 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms