RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 INSRRP14616 1297 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 BMP6P22004 513 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX10P56693 466 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MFSD10Q14728 455 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF180Q86T96 592 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 GDAQ9Y2T3 454 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 F2P00734 622 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 EMC2Q15006 297 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 CXCL17Q6UXB2 119 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KAT2BQ92831 832 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 PARVGQ9HBI0 331 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.35■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KPNA6O60684 536 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 PSEN2P49810 448 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 PPFIA1Q13136 1202 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MTFR1Q15390 333 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNA10Q16322 511 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KATNAL1Q9BW62 490 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 RFC5P40937 340 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 STK4Q13043 487 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF484Q5JVG2 852 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SFR1Q86XK3 245 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 DRC1Q96MC2 740 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF208Q9H0X6 261 aa29.34■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ARID2Q68CP9 1835 aa29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ASGR1P07306 291 aa29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 GAS2L3Q86XJ1 694 aa29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM143Q96AN5 459 aa29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TIPINQ9BVW5 301 aa29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBTB42B2RXF5 422 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ODR4Q5SWX8 454 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 LHX8Q68G74 356 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL10Q6JEL2 608 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 METTL13Q8N6R0 699 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 VTI1AQ96AJ9 217 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBTB10Q96DT7 871 aa29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 FRMD3A2A2Y4 597 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 GAP43P17677 238 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PSMD2Q13200 908 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 GRIK4Q16099 956 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 DAW1Q8N136 415 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MLKLQ8NB16 471 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF214Q8ND24 703 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHDC9Q8NEP7 349 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 CEP89Q96ST8 783 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 SETD4Q9NVD3 440 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 DACH1Q9UI36 760 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PPME1Q9Y570 386 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 BRCA2P51587 3418 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MAFO75444 373 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 CCL5P13501 91 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MAPK7Q13164 816 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC41Q15345 812 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 EXOC8Q8IYI6 725 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC71Q8N4P6 559 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PDLIM7Q9NR12 457 aa29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KLRC1P26715 233 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 GSE1Q14687 1217 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 C7orf31Q8N865 590 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KIFAP3Q92845 792 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 DEFB118Q96PH6 123 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MYH11P35749 1972 aa29.3■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KAT6AQ92794 2004 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF165P49910 485 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 NKX3-2P78367 333 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PLS3P13797 630 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PRCPP42785 496 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 PEX3P56589 373 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 STIM1Q13586 685 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 RETREG2Q8NC44 543 aa29.29■■■□□ 2.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms