RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531546.1

CASP4-210, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 2

Gene CASP4, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-210ENST00000531546 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 SLIT2O94813 1529 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 VPS72Q15906 364 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 KATNBL1Q9H079 304 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PIK3R4Q99570 1358 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 DISP2A7MBM2 1401 aa7.18□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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CASP4-210ENST00000531546 PHF19Q5T6S3 580 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 KCND1Q9NSA2 647 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 USP32Q8NFA0 1604 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 RREB1Q92766 1687 aa7.16□□□□□ -1.26
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CASP4-210ENST00000531546 H0Y858 1186 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 SLC27A2O14975 620 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 SUSD5O60279 629 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 HSPA6P17066 643 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PRELPP51888 382 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 RAC3P60763 192 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 GRIN1Q05586 938 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 DPTQ07507 201 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 FUKQ8N0W3 1084 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 C1orf159Q96HA4 380 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 CEP89Q96ST8 783 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 LAMC1P11047 1609 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.16□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PCNTO95613 3336 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 CKMP06732 381 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-210ENST00000531546 KIF15Q9NS87 1388 aa7.15□□□□□ -1.26
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CASP4-210ENST00000531546 RAD17O75943 681 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 GLRBP48167 497 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 AGBL4Q5VU57 503 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 STPG3Q8N7X2 389 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 FAM89AQ96GI7 184 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 DLC1Q96QB1 1528 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 CDIP1Q9H305 208 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.14□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 CUTAO60888 179 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 MAP4K2Q12851 820 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 TNNI3KQ59H18 835 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 CD276Q5ZPR3 534 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 EXTL1Q92935 676 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 SYT17Q9BSW7 474 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 GPR27Q9NS67 375 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ADGRL2O95490 1459 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ERBINQ96RT1 1412 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 UNCXA6NJT0 531 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 INHBCP55103 352 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 TUSC3Q13454 348 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASP4-210ENST00000531546 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.12□□□□□ -1.27
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