RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SP8Q8IXZ3 490 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SYT3Q9BQG1 590 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 EID1Q9Y6B2 187 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS20P59510 1910 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ESYT3A0FGR9 886 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NAT1P18440 290 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 EVA1CP58658 441 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 GUCY1A3Q02108 690 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PAK1Q13153 545 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 C4orf46Q504U0 113 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf27AQ580R0 203 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LILRB2Q8N423 598 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 APPBP2Q92624 585 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf48Q96LL4 319 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GTL3 188 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ANP32CO43423 234 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 APPP05067 770 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 MASP1P48740 699 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CR1LQ2VPA4 569 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LONRF3Q496Y0 759 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 STK32CQ86UX6 486 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NME8Q8N427 588 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KCNC2Q96PR1 638 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CEP89Q96ST8 783 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 MAF1Q9H063 256 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TMX1Q9H3N1 280 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CPS1P31327 1500 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SH3D21A4FU49 640 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 GRIN1Q05586 938 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TEPPQ6URK8 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LIPIQ6XZB0 460 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 JMYQ8N9B5 988 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KYQ8NBH2 561 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 NTMQ9P121 344 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 DSEQ9UL01 958 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 DIP2AQ14689 1571 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 KCNC1P48547 511 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SLURP1P55000 103 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ITGA1P56199 1179 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TUSC3Q13454 348 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 UBE4AQ14139 1066 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 PTPRUQ92729 1446 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB14O75071 495 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CRTAMO95727 393 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 LRG1P02750 347 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 ST5P78524 1137 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 HOMER1Q86YM7 354 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 CARFQ8N187 725 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL6Q8N841 843 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 SYT8Q8NBV8 401 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-214ENST00000530727 FBXW5Q969U6 566 aa5.23□□□□□ -1.57
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