RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 ZNF790Q6PG37 636 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 PTPRN2Q92932 1015 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 TNFRSF25Q93038 417 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 MBD4O95243 580 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 NLRP5P59047 1200 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 RCN1Q15293 331 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 BARGINQ6ZT62 677 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 PEX26Q7Z412 305 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 NUDT17P0C025 328 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 PIK3C2AO00443 1686 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 RPTORQ8N122 1335 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-205ENST00000527224 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DDB1Q16531 1140 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 KRT36O76013 467 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SERPING1P05155 500 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MPP2Q14168 576 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MAN2A1Q16706 1144 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 RFX8Q6ZV50 586 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 VCX3BQ9H321 246 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CUEDC2Q9H467 287 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 E7ENQ6 273 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SKIP12755 728 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PDE6AP16499 860 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 O00370 1275 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 GSTA2P09210 222 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 VHLP40337 213 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DR1Q01658 176 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 A6NJR5 290 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 NEK3P51956 506 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LRRC41Q15345 812 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TNKSO95271 1327 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CCDC188H7C350 402 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PLCG1P19174 1290 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 KLRC3Q07444 240 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ZNF365Q70YC5 407 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SPOCK2Q92563 424 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 HIC2Q96JB3 615 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DISP2A7MBM2 1401 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 NOL4O94818 638 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 RTP1P59025 263 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TIPINQ9BVW5 301 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TBK1Q9UHD2 729 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 FAM196BA6NMK8 535 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ACSL3O95573 720 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 KRT13P13646 458 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 STX2P32856 288 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 VSTM1Q6UX27 236 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TRIM9Q9C026 710 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CHKBQ9Y259 395 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PDLIM1O00151 329 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CAPN9O14815 690 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SUPT3HO75486 399 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms