RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 PRSS33Q8NF86 280 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 OSMRQ99650 979 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 CWH43Q9H720 699 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 HCSTQ9UBK5 93 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 LZTS1Q9Y250 596 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 GPR32O75388 356 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 C22orf31O95567 290 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 CYP3A4P08684 503 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 FGFR1P11362 822 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 LAG3P18627 525 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 DSC3Q14574 896 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 FBXL6Q8N531 539 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 METTL13Q8N6R0 699 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 S1PR5Q9H228 398 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 VTNP04004 478 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PLCB3Q01970 1234 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 KCNC3Q14003 757 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PHOX2BQ99453 314 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 HOXA2O43364 376 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 APOBRQ0VD83 1088 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 CASD1Q96PB1 797 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-210ENST00000527027 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 MAGEB2O15479 319 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 PSAPP07602 524 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TECP42680 631 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 MCTP2Q6DN12 878 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TCF25Q9BQ70 676 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 CDC27P30260 824 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 PPM1AP35813 382 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 RCAN1P53805 252 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 KRT17Q04695 432 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TCF15Q12870 199 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 PTPN21Q16825 1174 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ASIC4Q96FT7 647 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF558Q96NG5 402 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 RNF19AQ9NV58 838 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 AKT3Q9Y243 479 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ESYT2A0FGR8 921 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 HIDE1A8MVS5 230 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TMOD1P28289 359 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 CLCN3P51790 818 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 TMC7Q7Z402 723 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ABI1Q8IZP0 508 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 MAP7D2Q96T17 732 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 APOL5Q9BWW9 433 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 SPG21Q9NZD8 308 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-210ENST00000527027 USP34Q70CQ2 3546 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms