RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 NLRX1Q86UT6 975 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 KSR1Q8IVT5 923 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TIPINQ9BVW5 301 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ACAD9Q9H845 621 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MAFGO15525 162 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 RABGGTAQ92696 567 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 CHMP4BP1P59074 171 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TEX35Q5T0J7 233 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MYO6Q9UM54 1294 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 K7ENM7 598 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SLC9A1P19634 815 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PON1P27169 355 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PJA2O43164 708 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GBP6Q6ZN66 633 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ACTN1P12814 892 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PLS3P13797 630 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PRKG1Q13976 671 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 VGLL4Q14135 290 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MYBPC2Q14324 1141 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ANO9A1A5B4 782 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 UCHL3P15374 230 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 BACH1O14867 736 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MAGEA1P43355 309 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ASIC2Q16515 512 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ARID3AQ99856 593 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SIX2Q9NPC8 291 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PTPRFP10586 1907 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 STAM2O75886 525 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 KCNA2P16389 499 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TUBB4BP68371 445 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 DRC1Q96MC2 740 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM206Q9H813 350 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 OTOFQ9HC10 1997 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 RGS20O76081 388 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CYP2J2P51589 502 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CLCN6P51797 869 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R5AQ15172 486 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM58Q8NG06 486 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 GCNT4Q9P109 453 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 NFASCO94856 1347 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 LCTP09848 1927 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM150BA6NC51 233 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ENC1O14682 589 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CDHR1Q96JP9 859 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PLS1Q14651 629 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ACCSQ96QU6 501 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SPON1Q9HCB6 807 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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