RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SMARCA2	P51531	1590 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	NOBOX	O60393	691 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	BRINP1	O60477	761 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	CUTA	O60888	179 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL18	O94889	574 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	PRL	P01236	227 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ADRB1	P08588	477 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	LSP1	P33241	339 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC32	Q14392	662 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	GPR158	Q5T848	1215 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	BORA	Q6PGQ7	559 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	NUDT11	Q96G61	164 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TGM5	O43548	720 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	POLD1	P28340	1107 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	PHC1	P78364	1004 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SLC6A3	Q01959	620 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MAP3K12	Q12852	859 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	NFATC3	Q12968	1075 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	KANK2	Q63ZY3	851 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331		Q6ZUG5	572 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	NEMP1	O14524	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ULK1	O75385	1050 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	CD83	Q01151	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0G2JNJ9	132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MAFG	O15525	162 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RAB11FIP3	O75154	756 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	CELA3B	P08861	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ADCY8	P40145	1251 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RGS3	P49796	1198 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MOGS	Q13724	837 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TERF2	Q15554	542 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	DDB1	Q16531	1140 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	LGI4	Q8N135	537 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	KATNBL1	Q9H079	304 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331		Q9UFV3	132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	HMGXB3	Q12766	1538 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ETV4	P43268	484 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	BCAR1	P56945	870 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ADCY2	Q08462	1091 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	BROX	Q5VW32	411 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MCM8	Q9UJA3	840 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GFM2-208	ENST00000513331	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
GFM2-208	ENST00000513331	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
GFM2-208	ENST00000513331	APOL3	O95236	402 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GFM2-208	ENST00000513331	HMGCR	P04035	888 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GFM2-208	ENST00000513331	CSF2RB	P32927	897 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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